Die Runde der letzten 16 Teams wird am Sonntag, 23. November 2008, ausgespielt.
Die Begegnungen in der Übersicht:
Dynamo Dresden – FC Carl Zeiss Jena
1. FC Saarbrücken – Werder Bremen
Holstein Kiel – Türkiyemspor Berlin
1. FC Magdeburg – VfB Stuttgart
SV Babelsberg 03 – 1. FC Nürnberg
TuS Koblenz – MSV Duisburg
SC Freiburg – Hamburger SV
Borussia Dortmund – 1. FSV Mainz 05