Die Bundesliga-Absteiger SG Wattenscheid 09 und 1. FC Saarbrücken treten beide in der Süd-Staffel an. Dort starten auch die Aufsteiger FSV Jägersburg (Regionalliga Südwest) und FV Löchgau (Regionalliga Süd). In die Nord-Gruppe wurden die Aufsteiger SV BW Hohen Neuendorf (Regionalliga Nordost), SG Lütgendortmund (Regionalliga West) und Mellendorfer TV (Regionalliga Nord) eingeteilt.
Nord-Staffel:2008/2009
TeBe Berlin
1. FC Union Berlin
SV Victoria Gersten
FC Gütersloh 2000
Hamburger SV II
SV BW Hohen Neuendorf (Aufsteiger Nordost)
Holstein Kiel
1. FC Lokomotive Leipzig
SG Lütgendortmund (Aufsteiger West)
Mellendorfer TV (Aufsteiger Nord)
FFC Oldesloe
1. FFC Turbine Potsdam II
Süd-Staffel:2008/2009
SV Dirmingen
FCR 2001 Duisburg II
1. FFC Frankfurt II
ASV Hagsfeld
FSV Jägersburg (Aufsteiger Südwest)
Bayer 04 Leverkusen (ehemals TuS Köln rrh.)
FV Löchgau (Aufsteiger Süd)
FFC Wacker München
1. FC Saarbrücken (Absteiger Bundesliga)
SC Sand
VfL Sindelfingen
SG Wattenscheid 09 (Absteiger Bundesliga)
Die Saison beginnt am 7. September 2008.